Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP4Q8N3C7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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