Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PROM2Q8N271 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PROM2Q8N271 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PROM2Q8N271 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PROM2Q8N271 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PROM2Q8N271 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PROM2Q8N271 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PROM2Q8N271 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PROM2Q8N271 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PROM2Q8N271 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PROM2Q8N271 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PROM2Q8N271 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PROM2Q8N271 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PROM2Q8N271 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PROM2Q8N271 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PROM2Q8N271 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PROM2Q8N271 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PROM2Q8N271 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PROM2Q8N271 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PROM2Q8N271 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PROM2Q8N271 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PROM2Q8N271 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PROM2Q8N271 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PROM2Q8N271 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PROM2Q8N271 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PROM2Q8N271 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PROM2Q8N271 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PROM2Q8N271 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PROM2Q8N271 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PROM2Q8N271 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PROM2Q8N271 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PROM2Q8N271 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms