Protein–RNA interactions for Protein: Q8N145

LGI3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI3Q8N145 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LGI3Q8N145 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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LGI3Q8N145 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGI3Q8N145 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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