Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS2

CCDC65, Coiled-coil domain-containing protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC65Q8IXS2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC65Q8IXS2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms