Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF13Q86YI8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF13Q86YI8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms