Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSIG1Q86XK7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSIG1Q86XK7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms