Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW1

SLC51A, Organic solute transporter subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC51AQ86UW1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC51AQ86UW1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC51AQ86UW1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC51AQ86UW1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC51AQ86UW1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC51AQ86UW1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC51AQ86UW1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC51AQ86UW1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC51AQ86UW1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC51AQ86UW1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC51AQ86UW1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC51AQ86UW1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC51AQ86UW1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC51AQ86UW1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC51AQ86UW1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC51AQ86UW1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC51AQ86UW1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SLC51AQ86UW1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC51AQ86UW1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms