Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRAPQ7Z569 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRAPQ7Z569 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms