Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG9AQ7Z3C6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG9AQ7Z3C6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms