Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms