Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPN12Q6ZSI9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN12Q6ZSI9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms