Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF493Q6ZR52 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms