Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNT2Q6UVM3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms