Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNDC11Q6PKC3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms