Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCE2Q6PIF2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms