Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZCCHC12Q6PEW1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms