Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54Q6NXT1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ANKRD54Q6NXT1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms