Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF544Q6NX49 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms