Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOBEC3HQ6NTF7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms