Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN13Q6MZZ7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN13Q6MZZ7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms