Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV2

SMYD5, SET and MYND domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5Q6GMV2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD5Q6GMV2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMYD5Q6GMV2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms