Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCARA3Q6AZY7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SCARA3Q6AZY7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCARA3Q6AZY7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCARA3Q6AZY7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SCARA3Q6AZY7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARA3Q6AZY7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARA3Q6AZY7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms