Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CREB3L3Q68CJ9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms