Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SUSD4Q5VX71 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SUSD4Q5VX71 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms