Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF3Q5VWG9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF3Q5VWG9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms