Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOGA3Q5TF21 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms