Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAH2

SLC9C2, Sodium/hydrogen exchanger 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C2Q5TAH2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC9C2Q5TAH2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SLC9C2Q5TAH2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC9C2Q5TAH2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC9C2Q5TAH2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC9C2Q5TAH2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC9C2Q5TAH2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms