Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC34.51■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CCDC18Q5T9S5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC18Q5T9S5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms