Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC3LQ5T215 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms