Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SNAPC4Q5SXM2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SNAPC4Q5SXM2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SNAPC4Q5SXM2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SNAPC4Q5SXM2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SNAPC4Q5SXM2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SNAPC4Q5SXM2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SNAPC4Q5SXM2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SNAPC4Q5SXM2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SNAPC4Q5SXM2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SNAPC4Q5SXM2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SNAPC4Q5SXM2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SNAPC4Q5SXM2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SNAPC4Q5SXM2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SNAPC4Q5SXM2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SNAPC4Q5SXM2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
SNAPC4Q5SXM2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SNAPC4Q5SXM2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SNAPC4Q5SXM2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SNAPC4Q5SXM2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SNAPC4Q5SXM2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SNAPC4Q5SXM2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
SNAPC4Q5SXM2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SNAPC4Q5SXM2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SNAPC4Q5SXM2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SNAPC4Q5SXM2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SNAPC4Q5SXM2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SNAPC4Q5SXM2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SNAPC4Q5SXM2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SNAPC4Q5SXM2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms