Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CEP170Q5SW79 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CEP170Q5SW79 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms