Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9R7

PPP6R3, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP6R3Q5H9R7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP6R3Q5H9R7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP6R3Q5H9R7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms