Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COBLL1Q53SF7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms