Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC92Q53HC0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC92Q53HC0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC92Q53HC0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC92Q53HC0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC92Q53HC0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC92Q53HC0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC92Q53HC0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC92Q53HC0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC92Q53HC0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC92Q53HC0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC92Q53HC0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC92Q53HC0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC92Q53HC0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms