Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FBXO43Q4G163 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO43Q4G163 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms