Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIT2

PUS10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS10Q3MIT2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PUS10Q3MIT2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUS10Q3MIT2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms