Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC27Q2M243 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms