Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSPP1Q1MSJ5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CSPP1Q1MSJ5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms