Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPE65Q16518 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPE65Q16518 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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