Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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TNXAQ16473 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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TNXAQ16473 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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TNXAQ16473 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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TNXAQ16473 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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TNXAQ16473 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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TNXAQ16473 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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TNXAQ16473 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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TNXAQ16473 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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TNXAQ16473 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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TNXAQ16473 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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TNXAQ16473 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNXAQ16473 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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