Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZFHX3Q15911 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZFHX3Q15911 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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