Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms