Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PUM3Q15397 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
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