Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SF3B3Q15393 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SF3B3Q15393 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
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