Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC36.83■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
GAPVD1Q14C86 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC36.82■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC36.77■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC36.77■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
GAPVD1Q14C86 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
GAPVD1Q14C86 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
GAPVD1Q14C86 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
GAPVD1Q14C86 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
GAPVD1Q14C86 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
GAPVD1Q14C86 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
GAPVD1Q14C86 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
GAPVD1Q14C86 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
GAPVD1Q14C86 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC36.75■■■■□ 3.47
GAPVD1Q14C86 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
GAPVD1Q14C86 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
GAPVD1Q14C86 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
GAPVD1Q14C86 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
GAPVD1Q14C86 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
GAPVD1Q14C86 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
GAPVD1Q14C86 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
GAPVD1Q14C86 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
GAPVD1Q14C86 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
GAPVD1Q14C86 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
GAPVD1Q14C86 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
GAPVD1Q14C86 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
GAPVD1Q14C86 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
GAPVD1Q14C86 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
GAPVD1Q14C86 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
GAPVD1Q14C86 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
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