Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRIN2CQ14957 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2CQ14957 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms