Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEDD9Q14511 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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