Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB33AQ14088 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB33AQ14088 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB33AQ14088 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB33AQ14088 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB33AQ14088 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB33AQ14088 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB33AQ14088 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB33AQ14088 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB33AQ14088 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB33AQ14088 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB33AQ14088 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB33AQ14088 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB33AQ14088 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB33AQ14088 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB33AQ14088 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB33AQ14088 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB33AQ14088 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB33AQ14088 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB33AQ14088 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB33AQ14088 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB33AQ14088 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB33AQ14088 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB33AQ14088 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB33AQ14088 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB33AQ14088 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB33AQ14088 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB33AQ14088 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB33AQ14088 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms