Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFBQ13951 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
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