Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE7AQ13946 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE7AQ13946 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms